和果子据说起源于日本古代将树木的果实磨制成粉状并去除涩味之后揉制而成的圆形点心(后世称为“团子”)以及被称为日本最古老的加工食品的“饼”(年糕)。伴随历史的变迁,和果子也由于受到日本和中国唐朝的交流以及茶道兴起等影响而不断进化发展。到了江户时代,由于原材料供应以及制作工艺的不断进步,和果子的质量得到了飞跃式的提升。

和果子质量飞跃提升的主要原因,要归结于这段时期日本国内结束了连年的战乱,实现了持久的和平。在战乱时期人们为求生存而竭尽全力,没有余裕享受生活。迎来和平时代后,才终于可以发现和享受生活的乐趣,和果子也因此走进了寻常百姓的家庭。

地区都实行闭关锁国政策,在这段时期的各个领域,日本自身的独特文化都得以发展和充实,和果子的口味和制作工艺也不断进化提高,已经现代的和果子几无差别。
进入明治时代后(公元1869年以后),日本和西洋各国的交流日益频繁,西式点心以及烘焙工具的传入使得烘焙点心的种类得以增加也为和果子注入了新的内容并发展至今。